1996年，震惊全国的“四九女尸案”让人深感困惑。案件的凶手最终被确定为刚满18岁的呼格吉勒图，但让人不解的是，尽管缺乏明确的作案动机和直接证据，法院依然草率判定他为凶手，且在没有进一步调查的情况下直接执行了枪决。自此，呼格吉勒图的父母承受了“杀人犯家属”的恶名。令人更为震惊的是，时隔9年后，法院宣布案件判决错误，另有真凶。这个冤假错案背后隐藏着什么样的曲折故事呢？
案件发生在1996年4月5日傍晚，呼格吉勒图与朋友闫峰结束一天的工作后，一路上闲聊着走向家门。当他们经过一座公厕时，隐约听到从里面传来微弱的呼救声。两人犹豫片刻，但最终还是鼓起勇气走进厕所，发现了一名已经断气的年轻女子。震惊之下，二人慌忙报警。虽然他们作为好公民报警，然而这一举动却成了他们的噩梦。警察急于侦破案件，竟将二人当作了嫌疑人，并试图逼迫他们认罪。整整一夜的审讯中，闫峰在被释放后听到呼格吉勒图的惨叫，顿时意识到，自己的朋友恐怕将成为替罪羊。
闫峰立刻联系呼格吉勒图的父母，告诉他们这一切。当呼格的父母急匆匆赶到警察局时，看到的却是已经“定论”的证据：一份签字认罪书和站不住脚的所谓证据。接下来的几天，“四九女尸案”成为了媒体的头条，呼格吉勒图被迅速定罪，所有人都认为他是凶手。即便呼格的父母竭尽全力向各个机构上诉并寻求帮助，他们得到的答复始终是：证据确凿，死刑无法避免。
案件开庭一个半月后，法院在缺乏有效证据的情况下迅速判决，呼格被判处死刑，尽管他上诉请求再审，也未能改变命运。1996年6月10日，呼格吉勒图被执行了枪决，案件的背后仿佛有一股无形的力量推动着这一切的发生。一个18岁的年轻人仅因发现尸体报案，却成为了被错判死刑的受害者。
这起冤假错案的幕后，隐藏着一群急功近利的警察。负责此案的公安局副局长冯志明因此案破获，迅速晋升，被誉为“神探”。然而，代价是一个18岁少年的冤死以及一个家庭的支离破碎。作为普通人的呼格父母，面对权力和权威，几乎无力反抗。他们奔走于各个单位，努力为儿子争取平反，但面对冯志明及其庞大的后台，他们又能做些什么呢？
与此同时，呼格的父母除了心中的痛苦外，还要承受来自社会的舆论压力。呼格的父亲因长时间的悲痛而身患重病，母亲出门时常遭遇邻里的辱骂和殴打，而呼格的兄弟们也因为家庭的困境而影响了学业和工作。此时，几乎所有人都认为呼格就是“四九女尸案”的凶手，而他父母只能忍受这份无法摆脱的屈辱。
九年过去，局面终于发生转机。一名名叫赵志红的罪犯在被捕后供认了自己参与的10起案件，其中包括1996年4月9日的“四九女尸案”。他详细回忆了犯罪过程及作案地点，与当年的案件细节相吻合，真实的凶手终于浮出水面，这不仅证实了呼格是被冤枉的，也为呼格吉勒图的冤屈找到了合理解释。
然而，面对铁证如山的真相，当时的警方依旧选择视而不见。呼格的父母决定继续为儿子伸张正义，尽管他们已经深知这条路充满了艰难险阻。为了让案件得到重新审视，他们不断翻阅法律书籍，积累起大量资料，然而，曾经制造冤假错案的警察依旧高高在上，所有努力都遭到了严密的阻挠，案件的真相被掩盖了起来。
冯志明等人无所不用其极地干涉案件调查，然而，随着记者汤计的介入，局面终于发生了变化。汤计是一位著名的正义记者，他通过收集赵志红的口供以及案件的详细资料，坚信呼格吉勒图当年是被冤枉的，并公开发表了相关文章，揭露案件真相。这一报道引起了上级部门的重视，下令彻查此案。冯志明等人虽然开始将赵志红转移至其他地方，并试图抹去他口供中的“四九女尸案”部分，但最终还是在记者的坚持下，案件得到了重新调查。
随着案件的深入调查，冯志明等人的干预逐渐暴露。最终，赵志红在监狱中主动写下《偿命申请书》，承认了自己所犯的罪行，为呼格吉勒图的冤屈做出了公开道歉，并为自己所做的恶行承担责任。案件经过层层发酵，冯志明等人的所作所为被揭露，民众的愤怒逐渐不可遏制，司法机关也开始严肃调查。
2014年11月20日，内蒙古高级人民法院再次宣判，宣布呼格吉勒图无罪，冯志明等人也因制造冤案而受到了应有的惩罚。然而，冤屈的呼格吉勒图，已经永远离开了人世。尽管法院向呼格的家人致以深深的歉意，并给予了205万元的补偿，但这个年轻的生命已经无法挽回，呼格吉勒图的父母也再也无法改变那个失去儿子的现实。
